43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4090 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  99.54 
 
 
433 aa  843    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  51.54 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  50 
 
 
611 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  46.95 
 
 
278 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  46.95 
 
 
278 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  51.02 
 
 
336 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  42.12 
 
 
640 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  45.05 
 
 
476 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  45.39 
 
 
608 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  44.55 
 
 
544 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  46.41 
 
 
554 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  43.08 
 
 
360 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  45.29 
 
 
360 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  46.82 
 
 
418 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  42.69 
 
 
360 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  46.21 
 
 
555 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  44.59 
 
 
358 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  47.26 
 
 
555 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  47.26 
 
 
555 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  47.26 
 
 
555 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  44.28 
 
 
455 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  50.88 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  46.85 
 
 
117 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  45.54 
 
 
232 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  44.74 
 
 
246 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  43.1 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  44.83 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  49.38 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  43.36 
 
 
150 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  44.64 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  47.17 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  35.45 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  39.55 
 
 
152 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3764  hypothetical protein  35.15 
 
 
494 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1633  hypothetical protein  33.94 
 
 
494 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235606  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3629  hypothetical protein  29.25 
 
 
271 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3370  hypothetical protein  33.94 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3330  hypothetical protein  32.73 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0254985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2057  hypothetical protein  32.32 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  35.92 
 
 
240 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  31.3 
 
 
374 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1872  hypothetical protein  38.57 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.573397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>