18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1095 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  43.33 
 
 
278 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  43.33 
 
 
278 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  32.86 
 
 
232 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  42.37 
 
 
544 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  35.44 
 
 
455 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  35.62 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  34.83 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  38.98 
 
 
555 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  38.98 
 
 
555 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  38.98 
 
 
555 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  28.7 
 
 
476 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  38.98 
 
 
360 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  38.98 
 
 
360 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  37.29 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  28.4 
 
 
640 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  32.86 
 
 
117 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  28.7 
 
 
238 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>