40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1413 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  87.22 
 
 		 360 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  86.39 
 
 		 360 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  68.66 
 
 		 554 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  73.23 
 
 		 555 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  73.23 
 
 		 555 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  73.23 
 
 		 555 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  69.19 
 
 		 555 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  55.71 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  52.49 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  45.16 
 
 		 640 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  43.85 
 
 		 455 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  42.99 
 
 		 476 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  43.72 
 
 		 611 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  46.12 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  46.12 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  46.51 
 
 		 544 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  45.54 
 
 		 608 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  45.29 
 
 		 433 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  41.94 
 
 		 433 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  39.56 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  40.08 
 
 		 336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 		 423 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  50.45 
 
 		 117 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  47.06 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  46.73 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  43.64 
 
 		 238 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  42.45 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  45.95 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  35.45 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  44.07 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  41.75 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  36.11 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  34.04 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  32.26 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  41.67 
 
 		 525 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  24.11 
 
 		 117 aa  49.7  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  40.35 
 
 		 590 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  37.29 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>