38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1647 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  454  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  49.36 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  42.26 
 
 
235 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  42.44 
 
 
238 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  38.72 
 
 
233 aa  134  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  35.9 
 
 
232 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  37.77 
 
 
243 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  38.17 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  40.5 
 
 
336 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  45.6 
 
 
150 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  48.15 
 
 
544 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  46.79 
 
 
358 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  44.04 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  43.12 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  42.06 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  44.07 
 
 
117 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  44.04 
 
 
640 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  42.2 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  45 
 
 
554 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  40.37 
 
 
611 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  44.07 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  43.22 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  42.98 
 
 
360 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  42.74 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  40.54 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  40.65 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  40.65 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  48.18 
 
 
608 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  43.81 
 
 
455 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  29.09 
 
 
118 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  26.36 
 
 
117 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  39.22 
 
 
555 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  37.25 
 
 
555 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  37.25 
 
 
555 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  37.25 
 
 
555 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2723  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.00000000361112  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  42.19 
 
 
525 aa  42  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>