42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3457 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1195    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  65.74 
 
 		 640 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  69.45 
 
 		 608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  64.38 
 
 		 476 aa  279  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  52.11 
 
 		 544 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  50.46 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  52.17 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  44.25 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  48.37 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  43.81 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  43.36 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  43.72 
 
 		 360 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  47.47 
 
 		 555 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  47.47 
 
 		 555 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  50.45 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  47.47 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  50 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  40.89 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  45.02 
 
 		 336 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 278 aa  164  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  43.3 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  47.52 
 
 		 455 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  57.55 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  50.86 
 
 		 117 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  52.99 
 
 		 232 aa  115  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3332  hypothetical protein  34.82 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1097 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  49.07 
 
 		 238 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  47.86 
 
 		 246 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  51.89 
 
 		 233 aa  94  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  43.4 
 
 		 150 aa  91.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  49.09 
 
 		 243 aa  87  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  39.81 
 
 		 235 aa  85.5  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  40.37 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  43.01 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2409  conserved hypothetical fusion protein  30.96 
 
 		 823 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.827209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  39.62 
 
 		 240 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  36.11 
 
 		 152 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  24.77 
 
 		 118 aa  49.7  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  32 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  23.85 
 
 		 117 aa  48.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4156  hypothetical protein  32.02 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>