25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0587 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  100 
 
 		 1097 aa  2189    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  52.67 
 
 		 608 aa  125  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  47.62 
 
 		 640 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  43.66 
 
 		 611 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  32.67 
 
 		 196 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  30.56 
 
 		 191 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  45.33 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  40.24 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  31.71 
 
 		 199 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  34.59 
 
 		 200 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  37.35 
 
 		 197 aa  56.2  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  29.81 
 
 		 187 aa  54.7  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  36.47 
 
 		 587 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  30.49 
 
 		 197 aa  52  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 		 538 aa  50.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  39.51 
 
 		 503 aa  50.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 514 aa  50.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  33.73 
 
 		 159 aa  49.3  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  40.91 
 
 		 610 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 497 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  29.31 
 
 		 781 aa  46.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2658  hypothetical protein  30.69 
 
 		 403 aa  45.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.500683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>