30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2685 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  393  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  61.29 
 
 
199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  56.25 
 
 
197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  59.06 
 
 
187 aa  210  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  55.43 
 
 
191 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  30.14 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  36.06 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  32.09 
 
 
177 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  33.95 
 
 
514 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  31.87 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  31.93 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  31.02 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  35.16 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  35.26 
 
 
610 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  34.32 
 
 
608 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  32.81 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
503 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  30.25 
 
 
227 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  30.56 
 
 
1097 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  29.27 
 
 
538 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  30.82 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  32.21 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  30.36 
 
 
265 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  28.19 
 
 
170 aa  54.7  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  29.76 
 
 
265 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  28.07 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1299  hypothetical protein  40.96 
 
 
121 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0445  hypothetical protein  43.1 
 
 
112 aa  41.2  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0239  hypothetical protein  34.69 
 
 
123 aa  41.2  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>