34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1155 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1205    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  40.8 
 
 
497 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  34.18 
 
 
208 aa  89.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 
514 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  42.73 
 
 
190 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  36.63 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  36.05 
 
 
265 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  35.12 
 
 
197 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  36.31 
 
 
187 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  33.74 
 
 
158 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  34.97 
 
 
158 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  29.49 
 
 
538 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  41.05 
 
 
227 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  32.18 
 
 
218 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  31.18 
 
 
159 aa  65.1  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  39.55 
 
 
200 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  45.98 
 
 
170 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  36.6 
 
 
282 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  35.12 
 
 
197 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  35.65 
 
 
608 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  32.05 
 
 
177 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  35.36 
 
 
199 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2442  hypothetical protein  34.53 
 
 
495 aa  57.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  32.52 
 
 
191 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  30.32 
 
 
164 aa  50.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  31.74 
 
 
2132 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  37.61 
 
 
1097 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  28.24 
 
 
196 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.21 
 
 
2001 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  32.75 
 
 
1050 aa  44.3  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  32.75 
 
 
1075 aa  44.3  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3181  hypothetical protein  33.1 
 
 
451 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>