20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2348 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  42.94 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1097 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2347  hypothetical protein  31.61 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2336  hypothetical protein  56.36 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  26.34 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 497 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  27.72 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  29.77 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  28.07 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  31.68 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 514 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  25.13 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  26.58 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  28.24 
 
 		 610 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  32.47 
 
 		 159 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  25.95 
 
 		 265 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  35.21 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 503 aa  41.2  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>