31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1056 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  49.04 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  36.04 
 
 		 159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  35.29 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  30.14 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  31.66 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 		 497 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 		 503 aa  85.5  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  31.16 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  30.14 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  32.07 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  31.28 
 
 		 610 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  27.57 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  58.57 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  47.83 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 		 538 aa  75.5  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  30.48 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  27.96 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  32.22 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  47.14 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  26.27 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  37.04 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  45.33 
 
 		 1097 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  39.62 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  44.29 
 
 		 382 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  42.86 
 
 		 442 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  33.94 
 
 		 608 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>