31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0521 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  337  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  44.59 
 
 
177 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  41.06 
 
 
170 aa  111  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 
514 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 
497 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  37.41 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  40 
 
 
227 aa  91.3  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  36.54 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 
503 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  31.87 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  37.23 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  30.73 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  30.23 
 
 
538 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  29.36 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1299  hypothetical protein  43.68 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  31.02 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  35.17 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  29.73 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  34.48 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  28.11 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  26.27 
 
 
208 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  45.71 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  35.71 
 
 
1097 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  35.42 
 
 
746 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  36.78 
 
 
610 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  34.38 
 
 
200 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0239  hypothetical protein  31.82 
 
 
123 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  31.68 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  31.82 
 
 
587 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2347  hypothetical protein  37.88 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0445  hypothetical protein  28 
 
 
112 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>