32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0643 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 		 497 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  41.38 
 
 		 227 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 514 aa  97.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  36.71 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  35.46 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  36 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  35.81 
 
 		 197 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  36.54 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  32.16 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  32.31 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  30.77 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 		 538 aa  72.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  31.02 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1299  hypothetical protein  43 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  46.67 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0445  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  30 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0239  hypothetical protein  39.18 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  28.57 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  38.03 
 
 		 282 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  33.78 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  30.23 
 
 		 265 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1097 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  30.23 
 
 		 265 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  27.91 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  28.1 
 
 		 130 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  27.41 
 
 		 382 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>