87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2608 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  36.94 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  36.49 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  35.09 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  33.93 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  42.68 
 
 		 197 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  32.22 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  39.73 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  31.55 
 
 		 159 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  48.33 
 
 		 2851 aa  59.7  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  36.67 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  58.7 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  33.79 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  29.21 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  44.62 
 
 		 190 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  27.59 
 
 		 158 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  45.31 
 
 		 497 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  56.86 
 
 		 2914 aa  52.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.63 
 
 		 434 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  31.72 
 
 		 199 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  59.18 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50 
 
 		 451 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  39 
 
 		 610 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  51.67 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 		 538 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  48.21 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  55.93 
 
 		 542 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  50 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  59.18 
 
 		 645 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  50 
 
 		 439 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  50.88 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0545  hypothetical protein  43.1 
 
 		 377 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  58 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 503 aa  48.9  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  38.03 
 
 		 165 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  57.45 
 
 		 523 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  31.95 
 
 		 835 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  55.1 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  41.98 
 
 		 953 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  57.78 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 582 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  53.85 
 
 		 493 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  34.95 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  44.93 
 
 		 158 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  33.55 
 
 		 459 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  56.25 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  48.39 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  55.1 
 
 		 606 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  43.21 
 
 		 1426 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  53.85 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  56.82 
 
 		 813 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5441  Collagen triple helix repeat protein  46.77 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  56 
 
 		 689 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  56.82 
 
 		 748 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1097 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  56.82 
 
 		 706 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  55.56 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  65.85 
 
 		 842 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  57.45 
 
 		 492 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  56.25 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  56.82 
 
 		 1101 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  56.25 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  44.44 
 
 		 839 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  60 
 
 		 951 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  62.22 
 
 		 934 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  27.06 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  55.1 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  53.06 
 
 		 936 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  58.14 
 
 		 1451 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  47.76 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  57.45 
 
 		 1147 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  60 
 
 		 712 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1289  triple helix repeat-containing collagen  55.56 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  56.1 
 
 		 481 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2528  hypothetical protein  39.47 
 
 		 630 aa  42.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.803985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  44.44 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  56.1 
 
 		 478 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  55 
 
 		 435 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  59.09 
 
 		 643 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  56.82 
 
 		 1168 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  56.52 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  60 
 
 		 1170 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>