144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1289 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1289  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  69.43 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  70.7 
 
 		 936 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  66.24 
 
 		 813 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  68.12 
 
 		 462 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  63.41 
 
 		 512 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  66.27 
 
 		 748 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  47.41 
 
 		 842 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  63.92 
 
 		 712 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  71.94 
 
 		 706 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  60.39 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  50.47 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  68.46 
 
 		 606 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  68.24 
 
 		 1055 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  59.89 
 
 		 1451 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  63.98 
 
 		 1168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  66.46 
 
 		 1147 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  69.13 
 
 		 1219 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  59.01 
 
 		 585 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  60 
 
 		 815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  62.91 
 
 		 524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  61.69 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  74.17 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  74.17 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  66.89 
 
 		 348 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  53.48 
 
 		 643 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  57.06 
 
 		 835 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  61.33 
 
 		 481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  64.63 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  64.9 
 
 		 1580 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  52.05 
 
 		 835 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  63.57 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  55.35 
 
 		 867 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  54.97 
 
 		 1297 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  50.22 
 
 		 639 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  52.11 
 
 		 2914 aa  102  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  59.48 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  48.24 
 
 		 582 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  48 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  55.76 
 
 		 647 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  49.76 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  56.52 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  54.27 
 
 		 474 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  53.95 
 
 		 835 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.85 
 
 		 689 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  50.6 
 
 		 951 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.45 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.31 
 
 		 468 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  51.52 
 
 		 1321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  48.63 
 
 		 473 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  46.11 
 
 		 838 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  54.73 
 
 		 1170 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  51.66 
 
 		 934 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  50.36 
 
 		 1873 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  42.01 
 
 		 400 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  44.44 
 
 		 322 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  52.26 
 
 		 1101 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  47.45 
 
 		 493 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  44.32 
 
 		 835 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  51.77 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  44.1 
 
 		 492 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  39.88 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.21 
 
 		 587 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  49.15 
 
 		 445 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  41.61 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  68.54 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  58.4 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  70.59 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  48.92 
 
 		 523 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  41.72 
 
 		 442 aa  82.4  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  41.81 
 
 		 582 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  47.95 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  76.39 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  43.23 
 
 		 542 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  36.68 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  59.65 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  40.94 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3260  triple helix repeat-containing collagen  59.65 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.524263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  63.11 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  64.63 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  62.37 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  36.81 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  35.27 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  74.03 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  66.39 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  41.5 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  44.09 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  56.17 
 
 		 1148 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  42.96 
 
 		 2851 aa  69.7  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 717 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  66.92 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  37.84 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  50.47 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  49.04 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  45.08 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  54.49 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  33.74 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3507  collagen triple helix repeat protein  60.47 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  46.08 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>