31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0829 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  48.37 
 
 
208 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  44.85 
 
 
218 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  34.95 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  33.89 
 
 
197 aa  92  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  57.35 
 
 
514 aa  82  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  34.55 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  32.47 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  56.34 
 
 
497 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  30.89 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  31.91 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  31.58 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  42.72 
 
 
610 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  30.89 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28.42 
 
 
538 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  47.14 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  30.57 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  30.05 
 
 
265 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  30.1 
 
 
282 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  44.93 
 
 
382 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  44.32 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  43.48 
 
 
442 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  42.25 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  37.8 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  37.5 
 
 
608 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  33.75 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  33.78 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  39.76 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  40.51 
 
 
1097 aa  41.2  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>