29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0240 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  357  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  44.8 
 
 
227 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  41.06 
 
 
164 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  46.22 
 
 
497 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  40.17 
 
 
177 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  42.15 
 
 
514 aa  97.4  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  43.64 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  36 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
503 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  44.55 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.94 
 
 
538 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  36.89 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  34.43 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  47.14 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  39.73 
 
 
282 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  45.98 
 
 
610 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  35.71 
 
 
1097 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  28 
 
 
218 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  27.42 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  42.25 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  35.96 
 
 
608 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  28.67 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  33.01 
 
 
382 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  37.14 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  26.72 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  23.49 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  30.11 
 
 
746 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  38.24 
 
 
442 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>