35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0728 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  49.04 
 
 
208 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  46.7 
 
 
190 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  35.35 
 
 
497 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  37.62 
 
 
187 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  38.86 
 
 
197 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  41.3 
 
 
199 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 
514 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  36.06 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  34.7 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  32.11 
 
 
159 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  29.36 
 
 
177 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  29.36 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  29.44 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  41.23 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  29.51 
 
 
538 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  36 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
503 aa  68.6  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  28 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  30.2 
 
 
610 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  48.21 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1299  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  58.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  29.47 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  29.15 
 
 
158 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  41.18 
 
 
382 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0445  hypothetical protein  42.86 
 
 
112 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  38.24 
 
 
442 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  29.27 
 
 
265 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  35.96 
 
 
200 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  28.78 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2348  hypothetical protein  29.77 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  32.08 
 
 
1097 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  33.94 
 
 
608 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0239  hypothetical protein  35.62 
 
 
123 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2442  hypothetical protein  32.26 
 
 
495 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>