16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0239 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  253  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1299  hypothetical protein  40.86 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0445  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  39.18 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  25.62 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  35.62 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  31.82 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  27.78 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 497 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  30.77 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 514 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  36.67 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  30.38 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  28.77 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  29.11 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>