18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1688 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  274  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
463 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  41.07 
 
 
2002 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  34.41 
 
 
333 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1736  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
653 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  40.3 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  28.7 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  37.5 
 
 
316 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  42.25 
 
 
299 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  28.37 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  30.07 
 
 
746 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  39.18 
 
 
343 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  36.71 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  31.07 
 
 
1123 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
590 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  28.1 
 
 
165 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  32.43 
 
 
1022 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  34.33 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>