37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2886 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  49.36 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  41.95 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  41.53 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  38.49 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  40.68 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  39.17 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  38.87 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  51.81 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  41.28 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  38.21 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  39.25 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  37.4 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  37.39 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  41.23 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  38.98 
 
 		 360 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  36.11 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  38.14 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  36.84 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  39.62 
 
 		 611 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  43.69 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  37.96 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  42.06 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  43.02 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  26.61 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  23.85 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  38.37 
 
 		 640 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  36.27 
 
 		 418 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  52.27 
 
 		 608 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  33.66 
 
 		 555 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2723  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.00000000361112  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  34.65 
 
 		 555 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  34.65 
 
 		 555 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  34.65 
 
 		 555 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  35.92 
 
 		 433 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  35.92 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>