41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2123 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  896    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  71.19 
 
 		 544 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  54.21 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  46.6 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  47.52 
 
 		 611 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  48.04 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  43.98 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  47.55 
 
 		 278 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  43.36 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  43.11 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  44.66 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  46.31 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  38.67 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  47.52 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  40.2 
 
 		 640 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  41.33 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  44.27 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  44.27 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  44.27 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  43.75 
 
 		 555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  44.28 
 
 		 433 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  43.78 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  45.95 
 
 		 238 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  43.97 
 
 		 232 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  49.06 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  44.86 
 
 		 117 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  49.53 
 
 		 233 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  45.37 
 
 		 150 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  45.1 
 
 		 152 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  42.74 
 
 		 246 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  43.27 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3727  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.464181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  36.45 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  43.81 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  42.06 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  29.91 
 
 		 118 aa  57  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  28.04 
 
 		 117 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  33.02 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  39.06 
 
 		 525 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  35.63 
 
 		 341 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  37.29 
 
 		 590 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>