40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0920 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  43.4 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  41.35 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  41.84 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  42.44 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  39.83 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  39.57 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  38.49 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  50.89 
 
 		 455 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  56.88 
 
 		 358 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  46.02 
 
 		 476 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  46.49 
 
 		 640 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  51.33 
 
 		 423 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  49.07 
 
 		 611 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  49.09 
 
 		 278 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  48.65 
 
 		 117 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  45.89 
 
 		 455 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  48.18 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  47.22 
 
 		 544 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  42.58 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  48.18 
 
 		 360 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  48.18 
 
 		 360 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  46.43 
 
 		 554 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  44.55 
 
 		 336 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  43.64 
 
 		 360 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  47.83 
 
 		 555 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  47.83 
 
 		 555 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  47.83 
 
 		 555 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  44.14 
 
 		 608 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  43.16 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  41.9 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  43.1 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  43.1 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  29.36 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  28.44 
 
 		 118 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2723  hypothetical protein  32.03 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.00000000361112  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  40.38 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  38.55 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  35.94 
 
 		 525 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  28.7 
 
 		 341 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>