41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0791 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  46.22 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  47.81 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  43.4 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  48.33 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  40.68 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  38.25 
 
 		 544 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  35.9 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  52.99 
 
 		 611 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  50 
 
 		 640 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  41.67 
 
 		 455 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  51.89 
 
 		 358 aa  111  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  49.06 
 
 		 476 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  51.89 
 
 		 423 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  46.73 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  45.79 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  50.49 
 
 		 117 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  48.11 
 
 		 360 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  46.73 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  47.17 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  48.6 
 
 		 150 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  43.97 
 
 		 455 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  45.79 
 
 		 418 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  44.12 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  41.51 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  45.54 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  45.54 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  45.28 
 
 		 608 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2723  hypothetical protein  37.69 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.00000000361112  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  41.76 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  41.76 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  41.76 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  37.36 
 
 		 555 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  32.09 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  25.96 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  24.04 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  32.86 
 
 		 341 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  32.09 
 
 		 590 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1648  hypothetical protein  34.82 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>