37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3719 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
423 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  75.23 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  59.29 
 
 
476 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  58.41 
 
 
640 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  57.55 
 
 
611 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  56.19 
 
 
117 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  55.45 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  54.55 
 
 
360 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  54.63 
 
 
278 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  53.7 
 
 
278 aa  120  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  54.55 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  47.32 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  52.73 
 
 
418 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  51.43 
 
 
544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  51.82 
 
 
554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  51.33 
 
 
238 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  51.89 
 
 
232 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  53.64 
 
 
608 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  50.88 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  50.88 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  42.22 
 
 
336 aa  96.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  48.67 
 
 
246 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  52.73 
 
 
555 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  52.73 
 
 
555 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  52.73 
 
 
555 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  50.91 
 
 
555 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  49.06 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  40.19 
 
 
235 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  44.95 
 
 
233 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  42.99 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  40.54 
 
 
150 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  40.54 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  43.53 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  37.96 
 
 
240 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  34.55 
 
 
152 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  23.64 
 
 
118 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  21.82 
 
 
117 aa  43.5  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>