24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1870    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0299  hypothetical protein  45.45 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  26.7 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4099  hypothetical protein  34.33 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3772  hypothetical protein  31.58 
 
 		 380 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3721  hypothetical protein  31.58 
 
 		 380 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4001  hypothetical protein  31.58 
 
 		 379 aa  54.7  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2372  hypothetical protein  40.22 
 
 		 669 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000329046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0514  hypothetical protein  73.53 
 
 		 437 aa  50.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.37 
 
 		 398 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1899  hypothetical protein  26.57 
 
 		 399 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2606  hypothetical protein  28.44 
 
 		 362 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 479 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 479 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 479 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 458 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 428 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 479 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.9 
 
 		 479 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  31.34 
 
 		 580 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  32.41 
 
 		 421 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 421 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 417 aa  44.3  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>