38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0677 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 417 aa  860    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.85 
 
 		 408 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.87 
 
 		 402 aa  358  9e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.7 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  36.8 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  37.08 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  37.08 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  37.08 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  36.97 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  36.8 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  36.8 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  36.52 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  35.83 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  34.29 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.89 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  34.89 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  33.25 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.25 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.7 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  28.53 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  24.14 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  26.25 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.53 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  25.18 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  27.44 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  25.83 
 
 		 190 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  25.23 
 
 		 617 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  27.88 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  27.49 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  25 
 
 		 933 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  22.34 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>