38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4533 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 408 aa  838    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  69.29 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.6 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.85 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  37.53 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  37.53 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  38.4 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  38.59 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.88 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  37.19 
 
 		 422 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  38.03 
 
 		 419 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.48 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  38.64 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  38.64 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  38.64 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  38.53 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  38.35 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  37.17 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.48 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 395 aa  229  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  28.69 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 459 aa  99.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  31.13 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  25.52 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.51 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  27.23 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  24.79 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  24.29 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4236  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.21 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000155192  unclonable  0.0000114399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  27.45 
 
 		 617 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  26.8 
 
 		 190 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5250  hypothetical protein  23.6 
 
 		 532 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>