39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4119 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  90.52 
 
 
419 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  87.59 
 
 
419 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  90.52 
 
 
419 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  73.11 
 
 
423 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  77.27 
 
 
416 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  77.27 
 
 
416 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  77.27 
 
 
416 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  77.27 
 
 
416 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  77.27 
 
 
385 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  77.01 
 
 
416 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  58.06 
 
 
421 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  58.06 
 
 
421 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  61.62 
 
 
417 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  42.01 
 
 
395 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.94 
 
 
402 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.83 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.96 
 
 
402 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.72 
 
 
402 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.19 
 
 
408 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.83 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  30 
 
 
416 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  29.34 
 
 
415 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  33.09 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  29.32 
 
 
432 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  25.28 
 
 
459 aa  93.2  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  25.89 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  26.73 
 
 
399 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  26.44 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  26.64 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  26.4 
 
 
409 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  22.38 
 
 
545 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  23.98 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  47  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.71 
 
 
480 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.49 
 
 
481 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.92 
 
 
480 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.78 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  24.82 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>