29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1514 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  45.83 
 
 		 349 aa  292  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  43.23 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.05 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.5 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.79 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.77 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.04 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.9 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  26.7 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  32 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  24.55 
 
 		 403 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.44 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  26.64 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  24.32 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  23.61 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 415 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  22.83 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  24.03 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 421 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  23.95 
 
 		 421 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 399 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  25.23 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  25.23 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  25.23 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  25.23 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>