42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2169 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 459 aa  929    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.63 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.25 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.2 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  26.99 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.94 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  26.7 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  26.42 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  26.42 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  26.42 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  25.28 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  24.57 
 
 		 419 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  24.86 
 
 		 419 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  24.01 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.82 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.41 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  25.18 
 
 		 403 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  25.8 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  26.5 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  31.65 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  29.37 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  23.49 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.32 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  32 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  25.13 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  26.72 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.32 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  24.7 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>