36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0907 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 395 aa  800    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.68 
 
 		 407 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  49.16 
 
 		 402 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  41.88 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  42.15 
 
 		 419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  43.48 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  43.21 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  43.21 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  43.21 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  43.21 
 
 		 385 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  43.21 
 
 		 416 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  42.01 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  41.69 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  41.38 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  41.21 
 
 		 421 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  41.21 
 
 		 421 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  41.51 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 402 aa  242  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.63 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.29 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.37 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  26.49 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  26.54 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  31.62 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  26.27 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  26.03 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  23.48 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  22.76 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  35 
 
 		 617 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  31.68 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0018  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1233 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>