47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2629 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  75.41 
 
 
419 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  99.52 
 
 
416 aa  831    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  100 
 
 
385 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  99.28 
 
 
416 aa  828    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  833    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  90.78 
 
 
423 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  77.61 
 
 
419 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  74.52 
 
 
422 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  79.21 
 
 
419 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  64.58 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  64.58 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  62.86 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  41.12 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.22 
 
 
402 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.29 
 
 
407 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.15 
 
 
417 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.34 
 
 
402 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.83 
 
 
408 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.19 
 
 
402 aa  240  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  27.51 
 
 
415 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  28.31 
 
 
416 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  31.27 
 
 
403 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  30.83 
 
 
432 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  26.42 
 
 
459 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  25.92 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  26.13 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  28.98 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  28.29 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.14 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  28.83 
 
 
190 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.43 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  33.07 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.28 
 
 
480 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.5 
 
 
480 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.28 
 
 
481 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.28 
 
 
481 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.11 
 
 
477 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
428 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0803  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.31 
 
 
548 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
458 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
479 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
479 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
479 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
479 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.01 
 
 
479 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>