35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4533 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  31.71 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  30.7 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  29.64 
 
 		 437 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.14 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  26.2 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  26.2 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  26.2 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  26.2 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  26.2 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.81 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  26.43 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.12 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.15 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.18 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  25.22 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  25.71 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  25.89 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  25.53 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  25.24 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.52 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.82 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  22 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  26 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  20.44 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  23.7 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  22.83 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.28 
 
 		 481 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>