41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3036 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  100 
 
 		 385 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  99.48 
 
 		 416 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  99.22 
 
 		 416 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  91.44 
 
 		 423 aa  698    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  78.96 
 
 		 419 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  78.44 
 
 		 419 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  79.21 
 
 		 419 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  76.36 
 
 		 422 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  64.58 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  64.58 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  63.73 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.35 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.16 
 
 		 407 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.08 
 
 		 417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.77 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.6 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.91 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  31.27 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  30.8 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  26.2 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  28.98 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.14 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  28.83 
 
 		 190 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  33.07 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.43 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.28 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.5 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.28 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.28 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.29 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  24.38 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0803  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.31 
 
 		 548 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>