38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1024 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 402 aa  827    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  81.09 
 
 		 402 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  67.25 
 
 		 408 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.24 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  38.25 
 
 		 419 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  38.46 
 
 		 419 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  37.96 
 
 		 422 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  38.19 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.46 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.82 
 
 		 407 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  37.67 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  37.67 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  37.67 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  37.67 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  37.4 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  37.4 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  36.19 
 
 		 421 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 421 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 416 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.06 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  34.82 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  28.49 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  32.09 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  26.15 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  24.83 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  28.32 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  28.5 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  26.86 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  28.05 
 
 		 190 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0803  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.34 
 
 		 548 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0018  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1233 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  31.67 
 
 		 617 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>