51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4091 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 402 aa  822    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.63 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  44.17 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  44.39 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  44.35 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  44.35 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  44.35 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  44.35 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  44.29 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  44.08 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  43.8 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  41.15 
 
 		 422 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  43.21 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  42.78 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  42.78 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  41.8 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.06 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.48 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.84 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 415 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.31 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  29.62 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  29.82 
 
 		 432 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  25.18 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  26.05 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  27.2 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  26.14 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  31.77 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0018  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1233 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  33.12 
 
 		 190 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  24.88 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.88 
 
 		 481 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  23.84 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  26.69 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1368  hypothetical protein  25.4 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.553065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6795  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1867 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.57 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.84 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0378  hypothetical protein  27.91 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.61 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.84 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.84 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.84 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.84 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.84 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.61 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>