31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3869 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  80.23 
 
 		 428 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  72.03 
 
 		 477 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  98.75 
 
 		 480 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.38 
 
 		 479 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  93.14 
 
 		 481 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  92.31 
 
 		 481 aa  881    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  92.93 
 
 		 481 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.38 
 
 		 479 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 		 480 aa  977    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  92.93 
 
 		 481 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.38 
 
 		 479 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.38 
 
 		 479 aa  750    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.38 
 
 		 479 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  80.39 
 
 		 458 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6979  hypothetical protein  26.52 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  32.11 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.84 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  29.63 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  32.28 
 
 		 419 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  32.28 
 
 		 419 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  32.28 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  32.28 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  32.28 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  32.28 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  30.71 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  32.28 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0803  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.05 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.57 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  23.43 
 
 		 617 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>