28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3929 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  81.16 
 
 
428 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  73.15 
 
 
477 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
479 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  93.56 
 
 
480 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
481 aa  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  99.58 
 
 
481 aa  974    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  92.93 
 
 
480 aa  893    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 
481 aa  977    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
479 aa  762    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  91.68 
 
 
481 aa  882    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  81.05 
 
 
458 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
479 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
479 aa  762    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  79.21 
 
 
479 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6979  hypothetical protein  26.81 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  30.37 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.48 
 
 
421 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  30.48 
 
 
421 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  29.19 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  28.72 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  32.28 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  32.28 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  32.28 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  32.28 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  28.72 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.19 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  32.28 
 
 
385 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1253  hypothetical protein  23.47 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.237005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>