32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0486 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 415 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  52.72 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.18 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.24 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.11 
 
 		 402 aa  209  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.29 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.16 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  29.53 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  29.85 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.08 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  29.72 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  29.34 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  29.34 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.33 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  28.23 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  28.23 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  28.23 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  28.89 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  27.96 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  27.96 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  28.72 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  28.05 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  23.98 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  26.69 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  23.86 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  27.78 
 
 		 312 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>