35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2934 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  75.18 
 
 
419 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  99.28 
 
 
416 aa  828    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  99.22 
 
 
385 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  99.28 
 
 
416 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  834    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  90.53 
 
 
423 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  99.28 
 
 
416 aa  828    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  99.28 
 
 
416 aa  828    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  77.36 
 
 
419 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  74.28 
 
 
422 aa  628  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  78.95 
 
 
419 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  64.31 
 
 
421 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  64.31 
 
 
421 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  62.6 
 
 
417 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  41.12 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.71 
 
 
402 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.53 
 
 
407 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.9 
 
 
417 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.08 
 
 
402 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.74 
 
 
408 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.94 
 
 
402 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  27.44 
 
 
415 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  28.05 
 
 
416 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  30.89 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  26.99 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  30.83 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  26.2 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  29.55 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  26.52 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  27.91 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.14 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  28.83 
 
 
190 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.48 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6795  hypothetical protein  28.57 
 
 
1867 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0803  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.31 
 
 
548 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>