30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2136 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 409 aa  809    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  30.27 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  27.18 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  25.93 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.68 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.89 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  28.72 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  28.72 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  28.72 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  28.72 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  29.41 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  26.87 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  28.37 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.28 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.3 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  26.74 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  26.89 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  26.29 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.53 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  26.02 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  25.33 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.41 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  26.99 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.22 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>