39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2903 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
402 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  81.09 
 
 
402 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.87 
 
 
408 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.89 
 
 
417 aa  359  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  37.29 
 
 
419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  37.36 
 
 
419 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  34.87 
 
 
422 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  36.32 
 
 
421 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.32 
 
 
421 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  37.36 
 
 
419 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35 
 
 
407 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  35.91 
 
 
416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  35.91 
 
 
416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  35.91 
 
 
416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  36.29 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  35.91 
 
 
385 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  35.64 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  35.64 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  34.63 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  34.79 
 
 
417 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.71 
 
 
402 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  30.24 
 
 
415 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  30.29 
 
 
416 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  26.82 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  33.5 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  31.94 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  27.12 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  25.27 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  29.05 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  26.79 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  25.13 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  23.66 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  26.52 
 
 
349 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  29.09 
 
 
190 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  26.9 
 
 
617 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  27.81 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0018  hypothetical protein  28.57 
 
 
1233 aa  46.6  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0803  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.56 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5250  hypothetical protein  34.72 
 
 
532 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>