21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6858 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  720    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  62.91 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  45.83 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  25.08 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.2 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.63 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.86 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  26.56 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.52 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  28.32 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  20.44 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.29 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 459 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  27.65 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  26.47 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  24.45 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.34 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  24.82 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>