49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8131 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 398 aa  815    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  67.01 
 
 		 395 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  67.53 
 
 		 395 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  65.72 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  67.1 
 
 		 391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.97 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  64.71 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.17 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.17 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  63.9 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  63.32 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  61.74 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  56.22 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  54.66 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  48.43 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  50.6 
 
 		 333 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  38.44 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.83 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.39 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  32.13 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  31 
 
 		 1251 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  31.2 
 
 		 378 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  30.28 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  29.47 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  26.37 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  27.32 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  26.87 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.71 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  25.51 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  25.51 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  25.51 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  25.51 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  26.53 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.61 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.87 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.06 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.8 
 
 		 823 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  23.51 
 
 		 668 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  21.72 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.25 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  25.16 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.75 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  28.12 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.49 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  27.39 
 
 		 933 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1032 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1547  hypothetical protein  22.98 
 
 		 595 aa  43.5  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.180047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>