46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3711 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  81.22 
 
 
391 aa  663    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  83.5 
 
 
393 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  823    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  95.95 
 
 
395 aa  795    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  67.01 
 
 
398 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.74 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.14 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.14 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  64.14 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  63.97 
 
 
391 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  59.34 
 
 
414 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  58.82 
 
 
413 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  51.79 
 
 
395 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  51.54 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  51.2 
 
 
333 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  44.14 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  34.81 
 
 
415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.7 
 
 
381 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  29.22 
 
 
348 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  29.46 
 
 
1251 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  31.08 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.11 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.91 
 
 
432 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  25.45 
 
 
432 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  27.82 
 
 
350 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  27.98 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  25.26 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  25.26 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  25.26 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  26.36 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  25 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  27.82 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.68 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  25.13 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.59 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  23.72 
 
 
668 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.13 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  22.75 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  26.57 
 
 
823 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.43 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.64 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  25.56 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  25.12 
 
 
583 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0623  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.7 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.815723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>