47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0557 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 375 aa  727    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  32.09 
 
 		 413 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.93 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  29.02 
 
 		 432 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.5 
 
 		 432 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.89 
 
 		 461 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  28.52 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.48 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  25.96 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  26.99 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.45 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.45 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.45 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  26.25 
 
 		 1251 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.32 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  26.81 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.88 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.16 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  26.14 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.12 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  23.53 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  22.16 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  22.83 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  22.69 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  22.9 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  26.34 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  22.56 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  23.48 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  26.07 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  23.75 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  22.34 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  25.79 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  25.79 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  25.5 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  23.99 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  21.45 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  25.81 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.62 
 
 		 823 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  22.25 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.78 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.45 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  24.29 
 
 		 978 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1581  BNR domain-containing protein  32.76 
 
 		 663 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 549 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>