42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3918 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  720    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  55.94 
 
 
347 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  55.65 
 
 
347 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  55.65 
 
 
347 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  55.65 
 
 
347 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  44.38 
 
 
371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  38.32 
 
 
372 aa  210  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  39.61 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  38.66 
 
 
348 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.06 
 
 
361 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  38.35 
 
 
350 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  36.87 
 
 
1251 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  35.8 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.13 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  35.14 
 
 
366 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.85 
 
 
381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  27.6 
 
 
391 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  25.27 
 
 
395 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  25.87 
 
 
394 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.32 
 
 
398 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  26.61 
 
 
395 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  27.81 
 
 
413 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  27.39 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.15 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  29.31 
 
 
413 aa  96.3  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  27.04 
 
 
414 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  26.36 
 
 
395 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.15 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.15 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.2 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  26.12 
 
 
398 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.86 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.53 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  26.29 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.87 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  24.03 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  25.87 
 
 
432 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.24 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.71 
 
 
823 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.08 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.3 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  26.05 
 
 
583 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.632937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>