33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1920 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  100 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1211  hypothetical protein  43.97 
 
 		 151 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423693 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  41.74 
 
 		 223 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1165  putative tail fiber assembly-like protein  43.33 
 
 		 171 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3058  hypothetical protein  50.51 
 
 		 153 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.175828 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  37.04 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  36.72 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  36.61 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  36.61 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  31.03 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  28.21 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0746  hypothetical protein  48.28 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.0869427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  28.48 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  28.57 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  30.95 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  30.95 
 
 		 194 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  30.95 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  30.16 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  30.95 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  30.95 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  30.16 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  29.37 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  30.16 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  31.9 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  31.15 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  29.58 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  26.62 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  29.41 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  28.57 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  26.62 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  30.86 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  28.29 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  29.3 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>