19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1332 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  59.79 
 
 
292 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  48.95 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  41.74 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  32.66 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  30.53 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  26.46 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  27.18 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  25.65 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  24.34 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  25.48 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  29.23 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  24.6 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  26.67 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  26.67 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  26.84 
 
 
194 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  27.37 
 
 
200 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  25.77 
 
 
203 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  27.51 
 
 
206 aa  41.6  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>