32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1861 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  100 
 
 		 253 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  55.15 
 
 		 292 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  48.91 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  33.5 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  31.03 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  38.52 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  29.14 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  35.92 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  35.92 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  33.33 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  30.22 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  30.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  32.35 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  29.63 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  29.35 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  29.35 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  27.95 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  27.95 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  29.19 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  31.11 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  30.27 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  28.8 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  29.73 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  27.41 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  32.35 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  32.35 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  30.99 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  27.91 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  28.26 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  27.43 
 
 		 193 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  28.26 
 
 		 191 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  26.67 
 
 		 200 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>